Recherche
Génétique quantitative et évolution - Le Moulon
11 février 2022UMR AgroParisTech, INRAE, CNRS, Université Paris-Saclay
Orientation scientifique générale
L’UMR Génétique Quantitative et Évolution - Le Moulon (GQE – Le Moulon) a pour thématique scientifique principale l’étude de la génétique et de l’évolution des caractères à déterminisme complexe (caractères quantitatifs). Ses objectifs majeurs sont :
- Apporter des connaissances en génétique multifactorielle fondamentale, dans les domaines de la modélisation de la variation quantitative et de son évolution dans différentes populations ainsi que dans la recherche de locus à effets quantitatifs.
- Comprendre le contrôle génétique, épigénétique et moléculaire de caractères aussi bien qualitatifs que quantitatifs, leur importance dans l’histoire évolutive des espèces et leurs adaptations.
- Orienter et optimiser les démarches de sélection d’espèces cultivées sur des caractères cibles (croissance, développement, adaptation), en intégrant les avancées de la génomique, en valorisant les ressources génétiques, et en prenant en compte l’évolution des conditions environnementales et méthodes de culture.
Les modèles d’étude de GQE – Le Moulon varient selon les questions posées et les outils expérimentaux disponibles pour y répondre ; ils incluent des espèces d’intérêt agronomique (blé, maïs et colza), des espèces modèles (arabette des dames, levures) ainsi que non-modèles (nigelle).
Champs de recherche
L’unité est composée de six équipes de recherche et quatre équipes transversales :
- Biologie et adaptation des systèmes en évolution (BASE)
Modélisation de la variation quantitative et de son évolution, en intégrant les niveaux génétique, moléculaire, génomique, métabolique et environnemental. - Structure et évolution des chromosomes Fongiques (SECF)
Étude des modes de reproduction des levures hémiascomycètes, rôle dans histoire évolutive de Candida glabrata.
Génomique des populations, génomique comparée et fonctionnelle, et adaptation des levures à leur milieu. - Génomique Evolutive et Adaptation des plantes Domestiquées (GEvAD)
Caractérisation des variations nucléotidiques, structurales, épigénomiques impliquées dans l’évolution des génomes, la régulation de leur expression, et l’adaptation des populations. - Génétique, épigénétique et évolution de la morphogenèse florale (GE2MorF)
Mécanismes impliqués dans la diversité morphologique des pétales et la symétrie du périanthe.
Rôle de la diversité du périanthe dans l’adaptation et la diversification spécifique. - Diversité, évolution et adaptation des populations (DEAP)
Étude des bases génétiques de l’adaptation locale ; gestion dynamique de la biodiversité cultivée et son intérêt pour des agro-écosystèmes durables innovants ; sélection participative. - Génétique quantitative et méthodologie de la sélection (GQMS)
Étude des bases génétiques de caractères complexes et des mécanismes de réponse à la sélection, optimisation de la gestion des ressources génétiques et du processus de sélection.
- Atelier Cartographie, expression et polymorphisme
Projets communs de biologie moléculaire, veille technologique, développements méthodologiques pour des projets spécifiques. - Atelier de Bioinformatique et d’informatique
Analyse de la séquence des génomes, développement de logiciels et bases de données pour la génétique, informatique système et réseau. - Installation expérimentale
Expérimentation génétique en plein champ, essais agronomiques (blé et maïs principalement), accueil d’expériences pédagogiques pour l’université Paris-Saclay et AgroParisTech. - Plate-forme de protéomique PAPPSO (IBiSA)
Identification et quantification des protéines, analyse des modifications post-traductionnelles, développements méthodologiques, bioinformatique pour la protéomique.